본 발명은 미세 유체 칩을 이용한 유체 제어 장치에 관한 것으로, 본 발명의 일 실시예에 따른 미세 유체 칩을 이용한 유체 제어 장치는 유체가 통과하는 복수의 미세 유체 채널이 형성되는 채널 층과, 상기 채널 층의 하부에 형성되어 상기 미세 유체 채널을 개방 또는 차단시키는 유체막과, 상기 유체막의 하부에 위치하여 외부의 공기가 주입되는 복수의 에어홀이 형성되는 에어홀 층을 포함하는 미세 유체 칩과, 상기 에어홀에 공기를 주입하는 에어 밸브를 포함한다. 이에 따라, 미세 유체 칩의 미세 유체 채널을 정밀하게 제어하기 위해 채널과 맞닿는 유체막에 기 설정된 패턴으로 공기를 주입하여 채널을 개방 또는 차단시킴으로써 미세 유체의 흐름을 제어할 수 있다.