회귀 모델 기반 무정형 단백질의 앙상블 구조 예측 방법은 분석장치가 무정형 단백질인 타깃 단백질의 구조 정보를 획득하는 단계, 상기 분석장치가 상기 구조 정보를 기준으로 분자 동역학 시뮬레이션을 수행하는 단계, 상기 분석장치가 상기 분자 동역학 시뮬레이션 결과 데이터를 기준으로 상기 타깃 단백질을 구성하는 원자들의 화학적 이동을 예측하여 초기 화학적 이동 데이터를 생성하는 단계 및 상기 분석장치가 상기 초기 화학적 이동 데이터를 사전에 구축한 회귀 모델에 입력하여 화학적 이동값이 조정된 최종 앙상블 구조 데이터를 생성하는 단계를 포함한다.