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대규모 DNA 시퀀스 데이터베이스에 대해 특이성 조건을 만족하는 유효한 모든 프라이머들을 디자인하는 방법

Title
대규모 DNA 시퀀스 데이터베이스에 대해 특이성 조건을 만족하는 유효한 모든 프라이머들을 디자인하는 방법
Translated Title
A method for the thorough design of valid and target-specific primers for large-scale DNA sequence database
Inventors
김혜린구재형김선호김민수강나나전강욱
DGIST Inventors
구재형김민수; 강나나
Country
KO
Application Date
2015-04-15
Application No.
10-2015-0052999
Registration Date
2016-10-10
Registration No.
10-1666506
Assignee
(재)대구경북과학기술원(100/100)
URI
http://hdl.handle.net/20.500.11750/8784
https://doi.org/10.8080/1020150052999KIPRIS
Abstract
본 발명은 주어진 서열 데이터베이스에 대해 사용자에 의해 주어진 여러 필터링 제약조건들을 만족하고 그 특이성(Specificity)이 검증된 유효한 모든 커버리지(Coverage)의 프라이머쌍들을 디자인하는 방법에 관한 것으로, 주어진 DNA 서열 데이터베이스 상에 존재하는 모든 적합한 프라이머 쌍들을 빠짐없이 구하며, 커버리지(coverage)가 1인 프라이머들 뿐만 아니라 커버리지가 1보다 큰 프라이머들도 모두 구함으로써, 사용자가 결과 프라이머들 중 생물학적 실험의 성공률이 높은 프라이머들을 쉽게 선택할 수 있도록 프라이머 랭킹을 부여할 수 있도록 한 것이다.
Related Researcher
  • Author Kim, Min-Soo InfoLab
  • Research Interests Big Data Systems; Big Data Mining & Machine Learning; Big Data Bioinformatics; 데이터 마이닝 및 빅데이터 분석; 바이오인포메틱스 및 뉴로인포메틱스; 뇌-기계 인터페이스(BMI)
Files:
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Collection:
Department of New BiologyMolecular & Cellular Smell Biology Lab3. Patents
Department of Information and Communication EngineeringInfoLab3. Patents
ETC3. Patents


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