Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | 김혜린 | - |
| dc.contributor.author | 김선호 | - |
| dc.contributor.author | 강나나 | - |
| dc.contributor.author | 전강욱 | - |
| dc.contributor.author | 김민수 | - |
| dc.contributor.author | 구재형 | - |
| dc.date.accessioned | 2018-07-11T12:47:14Z | - |
| dc.date.available | 2018-07-11T12:47:14Z | - |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11750/8784 | - |
| dc.description.abstract | 본 발명은 주어진 서열 데이터베이스에 대해 사용자에 의해 주어진 여러 필터링 제약조건들을 만족하고 그 특이성(Specificity)이 검증된 유효한 모든 커버리지(Coverage)의 프라이머쌍들을 디자인하는 방법에 관한 것으로, 주어진 DNA 서열 데이터베이스 상에 존재하는 모든 적합한 프라이머 쌍들을 빠짐없이 구하며, 커버리지(coverage)가 1인 프라이머들 뿐만 아니라 커버리지가 1보다 큰 프라이머들도 모두 구함으로써, 사용자가 결과 프라이머들 중 생물학적 실험의 성공률이 높은 프라이머들을 쉽게 선택할 수 있도록 프라이머 랭킹을 부여할 수 있도록 한 것이다. | - |
| dc.title | 대규모 DNA 시퀀스 데이터베이스에 대해 특이성 조건을 만족하는 유효한 모든 프라이머들을 디자인하는 방법 | - |
| dc.title.alternative | A method for the thorough design of valid and target-specific primers for large-scale DNA sequence database | - |
| dc.type | Patent | - |
| dc.publisher.country | KO | - |
| dc.identifier.patentApplicationNumber | 10-2015-0052999 | - |
| dc.date.application | 2015-04-15 | - |
| dc.identifier.patentRegistrationNumber | 10-1666506 | - |
| dc.date.registration | 2016-10-10 | - |
| dc.contributor.assignee | (재)대구경북과학기술원(100/100) | - |
| dc.description.claim | 주어진 DNA 서열 데이터베이스를 받아 모든 가능한 최소길이와 최대길이 사이를 갖는 후보 프라이머들의 부분서열들을 추출하는 제1 단계; 상기 제1 단계에서 추출된 후보 프라이머들의 부분 서열들에 대해, 입력받은 Single Filtering 조건들을 적용하여 조건을 만족하지 않는 프라이머의 부분 서열을 제외하는 제2 단계;상기 제1 단계에서 추출된 후보 프라이머들의 부분 서열들인 Map1과, 상기 제2 단계에서 얻어진 Single Filtering 조건들을 통과한 후보 프라이머의 부분 서열 세트인 Map2를 페어조인을 하여 Map1의 프라이머와 Map2의 프라이머가 5' 끝부분을 제외하고 나머지 부분이 동일하면, Map2의 프라이머를 제거하는 제3 단계; 상기 제3 단계에서 Single Filtering 조건들을 통과한 후보 프라이머의 부분 서열인 Map2를 기 설정된 5' Cross-Hybridization Filtering 조건을 통과시켜, 통과된 후보 프라이머를 상기 Map1의 프라이머와 페어조인을 하여 Map1의 프라이머와 상기 5' Cross-Hybridization Filtering 조건을 통과한 프라이머가 주어진 불일치치수(#mismatch)를 제외한 나머지가 동일하면, 상기 5' Cross-Hybridization Filtering 조건을 통과한 프라이머를 제거하는 제4 단계; 상기 제4 단계 결과에서 여전히 남아있는 General Cross-Hybridization Filtering조건을 위반하는 False-Positive 프라이머들을 제거하는 제5 단계; 상기 제5 단계 결과에서 남아 있는 프라이머를 포워드 프라이머 세트와 리버스 프라이머 세트로 나누고, 나누어진 포워드 및 리버스 프라이머 세트에 대해 셀프조인을 위한 기 설정된 필터링 조건들을 적용하여 조건을 만족하지 않는 프라이머를 제외하는 제6 단계; 및 상기 제 6 단계를 통과한 프라이머 쌍들에 대해 패널티 점수를 계산하여 같은 sidset 그룹 내에서 패널티 점수에 따라 순차 정렬하는 제7 단계를 포함하는 대규모 DNA 시퀀스 데이터베이스에 대해 특이성 조건을 만족하는 유효한 모든 프라이머들을 디자인하는 방법. | - |
| dc.type.iprs | 특허 | - |
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